使用说明:
1. 本生物素标记EMSA探针用于EMSA结合反应时,参考如下步骤进行:
A. 如下设置EMSA结合反应:
阴性对照反应:
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Nuclease-Free Water
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7-7.5μl
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EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X)
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2μl
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细胞核蛋白或纯化的转录因子
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0μl
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生物素标记探针
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0.5-1μl
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总体积
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10μl
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样品反应:
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Nuclease-Free Water
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5-5.5μl
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EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X)
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2μl
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细胞核蛋白或纯化的转录因子
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2μl
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生物素标记探针
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0.5-1μl
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总体积
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10μl
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探针冷竞争反应:
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Nuclease-Free Water
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4-4.5μl
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EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X)
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2μl
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细胞核蛋白或纯化的转录因子
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2μl
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未标记的探针
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1μl
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生物素标记探针
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0.5-1μl
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总体积
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10μl
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突变探针的冷竞争反应:
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Nuclease-Free Water
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4-4.5μl
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EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X)
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2μl
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细胞核蛋白或纯化的转录因子
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2μl
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未标记的突变探针
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1μl
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生物素标记探针
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0.5-1μl
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总体积
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10μl
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Super-shift反应:
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Nuclease-Free Water
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4-4.5μl
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EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X)
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2μl
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细胞核蛋白或纯化的转录因子
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2μl
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目的蛋白特异抗体
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1μl
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生物素标记探针
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0.5-1μl
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总体积
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10μl
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注:生物素标记EMSA探针的推荐用量为每个反应0.5微升,如果检测出来的目的蛋白的EMSA条带偏弱,可以适当加大生物素标记EMSA探针的用量至0.75微升或1微升。
注2:对于冷竞争时使用的未标记的探针或未标记的突变探针,使用量可以根据实际情况调整使用的体积。推荐的用于冷竞争的未标记的探针或突变探针的用量为生物素标记探针的50-100倍。
B.按照上述顺序依次加入各种试剂,在加入标记好的探针前先混匀,并且室温(20-25℃)放置10分钟,从而消除可能发生的探针和蛋白的非特异性结合,或者让冷探针优先反应。然后加入标记好的探针,混匀,室温(20-25℃)放置20分钟。
C.加入1μl EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(无色,10X),混匀后立即上样。注意:有些时候溴酚蓝会影响蛋白和DNA的结合,建议尽量使用无色的EMSA/Gel-Shift上样缓冲液。如果对于使用无色上样缓冲液在上样时感觉到无法上样,可以在无色上样缓冲液里面添加极少量的蓝色的上样缓冲液,至可以观察到蓝颜色即可。