DIA/SWATH定量蛋白质组学
DIA(data-independent acquisition)/SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical Mass Spectra)是一项区别于DDA采集的全新的、全息式的质谱技术,将扫描范围划分为以25 Dalt为间隔的一系列区间,通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息,是 MS/MS ALL技术的扩展。DIA/SWATH技术是一种真正全景式、高通量的质谱技术,同时也大大提高了定量的可重现性。
碧云天DIA/SWATH定量技术原理
DIA/SWATH采用数据非依赖性的扫描采集模式,将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂,使用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量,从而获得完整的肽段信息。
DIA/SWATH技术示意图
碧云天DIA/SWATH技术服务项目表
服务编号 |
服务名称 |
服务时间(工作日) |
全额预付特价(元)/样本 |
半额预付特价(元)/样本 |
零首付价(元) /样本 |
交付结果 |
T2307 |
DIA/SWATH |
45-50 |
12500 |
14000 |
14800 |
- 蛋白质检报告;
- 实验报告;
- 生物信息学分析结果;
- 质谱检测原始数据
|
T2309 |
组织提取定量 |
≤10 |
390 |
420 |
460 |
T2310 |
血液样本前处理 |
1300 |
1400 |
1550 |
碧云天DIA/SWATH技术服务询价与订购
- 请您下载并填写《碧云天蛋白质组学服务询价单》,发送至service@beyotime.com,我们将为您设计最佳方案。
- 若有订购意向,碧云天的技术服务人员会与您联系,并签订《碧云天蛋白质组学技术服务协议书》。
- 送样时,请下载并填写《碧云天蛋白质组学生物样品信息表》,发送至service@beyotime.com或碧云天蛋白质组学技术服务人员邮箱。样品的具体要求参见《碧云天蛋白质组学生物送样要求》。
碧云天DIA/SWATH技术特点
- 更高的覆盖率和精确度,兼具shot-gun法的高通量以及SRM法的可重复性。
- 无需同位素标记。
- 质谱操作简便无需分组份,样本处理少,软件及数据库运行效率高。
- 适用于研究亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物样本。
碧云天DIA/SWATH技术服务客户须知
- 建议送原始样本,除非客户已经熟练掌握蛋白质组学的蛋白提取方法。
- 动物组织样品:湿重不少于200 mg,样品不能溶血,PBS灌注冲洗组织直至去除血液。软骨或骨头等样本,建议不低于400 mg。
- 植物组织样品:湿重不少于2 g,取材后用PBS冲洗至少3遍直至去除杂质。
- 菌体样品:原则上只接受常见无毒菌的菌体样品,菌体沉淀不少于100 mg或者体积不少于100 μL;若为含有毒菌的菌体样品或菌体裂解液,按照《病原微生物技术服务操作指南》执行。
- 细胞样品:收集细胞沉淀,PBS冲洗3遍(以防残留血清中的白蛋白影响鉴定结果),送样量为1×107或细胞沉淀不少于50 μl。
- 培养基上清液:需保证无菌体或细胞(用0.2 μm膜过滤),条件允许可浓缩后再寄送;送样体积不少于10 ml。
- 血清样品:新鲜血液取出后,4℃,2000 g,离心15 min,取上清,即得血清;血清制备过程中保证不能溶血;血清体积要求不少于500 μl;制备血清过程中,客户可根据自己样品和实验要求选择是否添加抗凝剂,一般不用添加。
- 若客户直接提供蛋白样品,则蛋白量不少于1 mg,浓度不低于2 mg/mL。
- 样品的具体要求及寄送条件详见《碧云天蛋白质组学生物送样要求》及《碧云天蛋白质组学生物样品信息表》。
碧云天DIA/SWATH技术服务流程
碧云天DIA/SWATH技术服务承诺
碧云天承诺提供:
完整的蛋白质组学实验报告(包括具体实验流程);
生物信息学分析结果;
蛋白质谱检测原始数据;
蛋白质检报告。
碧云天DIA/SWATH技术服务应用方向
适用于大规模蛋白定量分析,通量高;对检测灵敏度、精确度和覆盖率要求高的客户;无物种限制,可以应用到如农业植保、畜牧兽医、动医动科、水产、生物医学等多领域。
应用案例
Ying S Ting, et al., PECAN: library-free peptide detection for data-independent acquisition tandem mass
spectrometry data, Nat. Methods, 2017.
应用技术:DIA(data-independent acquisition)
IF:11.58