Cell |长非编码RNA种属特异性加工决定其功能差异
文中对其中一个新型的长非编码RNA——hFAST维持人胚胎干细胞自我更新的分子机制进行了详细解析。FAST是基因组位置保守的长非编码RNA,在胚胎干细胞中特异高表达。在人、猴来源的胚胎干细胞FAST定位在细胞质内,维持胚胎干细胞的自我更新。机制研究表明,在人胚胎干细胞中,细胞质定位的hFAST结合E3泛素连接酶β-TrCP蛋白的WD40结构域,阻止其与磷酸化β-catenin相互作用,使得β-TrCP不能降解重要信号通路WNT中关键蛋白β-catenin,从而维持WNT信号通路持续激活和干细胞的自我更新。在鼠胚胎干细胞中,mFast定位在细胞核内,不能结合β-TrCP,也不影响WNT信号通路和干细胞多能性。
为了进一步探究长非编码RNA在不同物种间加工定位差异的分子机制,研究人员结合生物信息学分析预测和实验验证筛选到了调控它们不同定位的关键因子PPIE。在鼠胚胎干细胞中,PPIE蛋白高表达并抑制长非编码RNA (包括mFast)的剪接加工而使其滞留在细胞核内;在人胚胎干细胞中,PPIE蛋白低表达,长非编码RNA被剪接加工,运输到细胞质内发挥功能;而在猴胚胎干细胞中PPIE蛋白的表达、FAST以及其它长非编码RNA在细胞内的定位和功能则更趋向于人胚胎干细胞。
该项研究首次发现非保守的RNA加工和定位在长非编码RNA发挥功能过程中具有重要作用,为了验证hFAST对hESC多功能性维持的影响,文中使用了碧云天的结晶紫染色液对正常和hFAST敲除的H9细胞菌落进行染色,发现hFAST敲除会损坏H9细胞的菌落形成能力。
产品编号 | 产品名称 | 包装 | 产品价格 |
C0121 | 结晶紫染色液 | 100ml | 83.00 |
论文链接:Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved functions in stem cells https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.03.006