化学信息：
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化学名
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N-hydroxy-4-[(2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide
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简称
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Tubastatin A
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别名
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Tubastatin-A, Tubastatin A BASE
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中文名
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N/A
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化学式
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C20H21N3O2
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分子量
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335.4
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CAS号
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1252003-15-8
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纯度
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98%
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溶剂/溶解度
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Water<1mg/ml; DMSO9mg/ml; Ethanol<1mg/ml
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溶液配制
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5mg加入1.49ml DMSO，或者每3.35mg加入1ml DMSO，配制成10mM溶液。SD1155-10mM用DMSO配制。
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生物信息：
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产品描述
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Tubastatin A是一种有效的，选择性HDAC6抑制剂，无细胞试验中IC50为15nM，选择性远高于所有其他同工酶(1000倍)除了HDAC8(57倍)。
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信号通路
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Epigenetics; DNA Damage; NF-κB
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靶点
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HDAC6
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－
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－
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－
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－
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IC50
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15nM
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－
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－
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－
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体外研究
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Tubastatin A选择性作用于所有同工酶除了HDAC8，对所有亚型不含HDAC8，保持超过1000倍的选择性，对HDAC8具有约57倍的选择性。2.5μM Tubastatin A优先诱导α-tubulin 高度乙酰化。10μM Tubastatin A轻微诱导组蛋白乙酰化。Tubastatin A 5μM开始对同型半胱氨酸诱导的神经元细胞死亡具有保护作用，这种作用具有剂量依赖性，10μM时，达到完全保护。Tubastatin A (10μM)作用于胆管癌细胞系，诱导乙酰化的α-tubulin水平增加和初级纤毛表达的恢复，初级纤毛表达的恢复与下调Hedgehog (Hh)和MAPK信号通路，以及减少细胞增殖率(平均50%)和浸润(40%)相关。Tubastatin A作用于LPS刺激的人类THP-1巨噬细胞，显著抑制TNF-α和IL-6，IC50分别为272nM和712nM。Tubastatin A作用于小鼠Raw 264.7巨噬细胞，抑制一氧化氮(NO)分泌，这种作用具有剂量依赖性，IC50为4.2μM。
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体内研究
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Tubastatin A降低体内胆管癌的生长。Tubastatin A(10mg/kg)处理同基因大鼠原位胆管癌模型，诱导低于平均瘤重6倍，降低肿瘤重量与肝脏重量和体重(分别为5和5.6倍)的比值。Tubastatin A处理肿瘤，与对照组相比，显著降低PCNA阳性细胞的量(34% vs 65%)。Tubastat A按30mg/kg剂量腹腔注射给药弗氏完全佐剂(FCA)诱导的动物炎症模型，显著抑制鼠爪体积。Tubastat A(30mg/kg 腹腔注射)处理胶原诱导型关节炎DBA1小鼠的爪子组织，显著降低临床评分(~70%)和IL-6表达。
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临床实验
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N/A
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特征
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N/A
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相关实验数据(此数据来自于公开文献，碧云天并不保证其有效性)：
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酶活性检测实验
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方法
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Tubastatin A在实验Buffer(50mM HEPES，pH 7.4，100mM KCl，0.001% Tween-20，0.05% BSA和20μM tris(2-carboxyethyl)phosphine)中溶解和稀释到终浓度的6倍。HDAC酶在实验Buffer中稀释到终浓度的1.5倍，与Tubastatin A预温育10分钟，然后加入底物。通过滴定曲线测得，用于每种酶的FTS(HDAC1、HDAC2、HDAC3和HDAC6)或MAZ-1675(HDAC4、HDAC5、HDAC7、HDAC8和HDAC9)量等于米氏常数(Km)。使用0.3μM测序级胰蛋白酶将FTS或MAZ-1675在实验Buffer中稀释到终浓度的6倍。底物/胰蛋白酶混合物加入到酶/化合物混合物中，震荡实验板60秒，然后置于SpectraMax M5酶标仪上。赖氨酸侧链在肽底物中脱乙酰化后，监测酶促反应的7-amino-4-methoxy-coumarin释放，监测30分钟，计算反应的线性速率。
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细胞实验
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细胞系
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人体胆管癌细胞系HuCCT-1
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浓度
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~10μM
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处理时间
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21天
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方法
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细胞生长在软琼脂中，测评锚定非依赖性生长。约25000个细胞悬浮在培养基的0.4%琼脂中，超过1%琼脂层在6孔板中。每周加入两次培养基，温育21天，拍摄图片。使用Gel-Pro软件分析菌落的数量和尺寸。
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动物实验
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动物模型
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携带胆管癌移植瘤BDEneu的大鼠
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配制
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N/A
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剂量
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10mg/kg
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给药方式
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每天腹腔注射
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参考文献：
1. Butler KV, et al. J Am Chem Soc, 2010, 132(31), 10842-10846.
2. Gradilone SA, et al. Cancer Res, 2013, 73(7), 2259-2270.
3. Vishwakarma S, et al. Int Immunopharmacol, 2013, 16(1), 72-78.
4. Santo L, et al. Blood, 2012, 119(11), 2579-2589.
包装清单：
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产品编号
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产品名称
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包装
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SD1155-10mM
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Tubastatin A (HDAC抑制剂)
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10mM×0.2ml
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SD1155-5mg
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Tubastatin A (HDAC抑制剂)
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5mg
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SD1155-25mg
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Tubastatin A (HDAC抑制剂)
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25mg
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说明书
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1份
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保存条件：
-20℃保存，至少一年有效。5mg和25mg包装也可室温保存，至少6个月有效。如果溶于非DMSO溶剂，建议分装后-80℃保存，预计6个月内有效。
注意事项：
本产品仅限于专业人员的科学研究用，不得用于临床诊断或治疗，不得用于食品或药品，不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。
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