使用说明:
FnCas12a (Cpf1)体外消化靶DNA
1.溶解并混匀体外消化反应所需的各种溶液。将FnCas12a、gRNA、底物DNA置于冰浴上,使用无核酸酶水稀释gRNA至300nM,底物DNA至30nM。
2.按照下表配制反应体系(以30μl体系为例):
Reagent |
Volume |
Nuclease-free water |
20µl |
10X Reaction Buffer |
3µl |
gRNA (300nM) |
3µl |
FnCas12a (1μM) |
1µl |
Total Reaction Volume |
27µl |
3.用移液器轻轻吹打混匀或轻微Vortex混匀,室温离心数秒,使液体积聚于管底。25℃预孵育10min。
4.加入3μl 30nM底物靶DNA (30μl最终体积),轻轻混匀(用移液器轻轻吹打混匀或用涡旋混合器在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体,37℃孵育10min。
5.向每个样品中加入1μl
蛋白酶K (ST532),轻轻混匀, 室温孵育10min。
6.向反应体系中加入6μl
DNA上样缓冲液(6X) (D0071),然后使用1%琼脂糖凝胶进行电泳分析。
参考文献:
1.Gao P, Yang H, Rajashankar KR, Huang Z, Patel DJ. Cell Res. 2016. 26(8):901-13.
2.Makarova KS, Wolf YI, Alkhnbashi OS, Costa F, Shah SA, et al. Nat Rev Microbiol. 2015. 13(11):722-36.
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