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RNA高效生物素标记:1μg模板近10μg产物

生物素标记RNA被广泛用于Northern、Southern、原位杂交、RNase保护实验(RNase Protection Assay)、RNA蛋白相互作用、RNA折叠等相关研究【1】。碧云天研发生产的Biotin RNA Labeling Kit (SP6/T7),即RNA生物素标记试剂盒(SP6/T7),是一种通过高效的SP6 RNA polymerase或T7 RNA polymerase进行体外转录,从而获得生物素标记的RNA探针的试剂盒。使用1μg的线性化DNA模板(长度约3kb),37℃孵育2小时,转录产物长度约为500nt时,可合成约8-10μg生物素标记的RNA。该试剂盒可以配合质粒pRNA-SP6-T7 (RNA体外转录质粒) (D2314)或其它在多克隆位点两侧有SP6或T7 promoter的质粒,在多克隆位点插入目的基因并线性化后使用。

产品原理
该试剂盒是利用带有SP6 Promoter (ATTTAGGTGACACTATAG)或T7 Promoter (TAATACGACTCACTATAGGG)的线性化质粒、PCR产物或合成的DNA片段等为模板,利用SP6 RNA Polymerase或T7 RNA Polymerase能在相对较短的时间内进行体外RNA转录的特性,以Biotin-16-UTP部分取代UTP,从而转录生成生物素标记的RNA探针。

产品效果
碧云天Biotin RNA Labeling Kit (SP6/T7)以带有SP6或T7 Promoter的线性化质粒DNA为模板进行转录时的产量参考图1。本试剂盒在标准的RNA转录反应条件下,在20μl的反应体系中,使用1μg的线性化DNA模板(长度约3kb),37℃孵育2小时,转录产物长度约为500nt时,可合成约8-10μg生物素标记的RNA。合成的标记RNA的数量取决于模板DNA的数量、纯度以及转录产物的长度。进一步延长孵育时间并不会增加生物素标记RNA的产量,但可以通过按比例放大反应体系,获得更多的生物素标记RNA。

图1.碧云天Biotin RNA Labeling Kit (SP6/T7) (R7061)的产量参考图。

图2.碧云天Biotin RNA Labeling Kit (SP6/T7) (R7061)转录合成生物素标记的RNA探针的检测效果图。实验结果显示,与未进行生物素标记的RNA探针相比,使用本试剂盒生成的RNA探针能明显检测到生物素的存在,表明生物素成功标记在RNA上。

产品特点
获得的RNA探针应用范围广:本试剂盒转录合成的带生物素标记的RNA探针可用于Northern、Southern、原位杂交、RNase保护实验(RNase Protection Assay)等相关研究;

后续兼容多种检测方法:本试剂盒转录合成的带有生物素标记的RNA探针可以使用荧光基团、酶或抗体偶联的链霉亲和素(Streptavidin)进行检测。推荐使用辣根过氧化物酶标记Streptavidin (A0303A0305)DAB辣根过氧化物酶显色试剂盒(P0202/P0203)BeyoECL Moon (P0018F)联合使用进行检测,或者使用碱性磷酸酯酶标记Streptavidin (A0312)BCIP-NBT碱性磷酸酯酶显色试剂盒(C3206)联合使用进行检测。

产品信息:

产品编号 产品名称 包装 产品价格
R7061S Biotin RNA Labeling Kit (SP6/T7) 20次
R7061M Biotin RNA Labeling Kit (SP6/T7) 100次

参考文献
[1] Huang, F., He, J., Zhang, Y., & Guo, Y. (2008). Synthesis of biotin-AMP conjugate for 5' biotin labeling of RNA through one-step in vitro transcription. Nature protocols, 3(12), 1848–1861.