pUCm-T载体

 产品编号: D2006
 产品包装: 20次
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D2006 pUCm-T载体 20次 246.00元

    pUCm-T载体(pUCm-T Vector)是用于克隆含有A末端PCR产物的理想载体。可以通过蓝白斑筛选有插入片段的重组克隆。
    很多DNA聚合酶在进行PCR扩增时会在PCR产物双链DNA每条链的3’端加上一个突出的碱基A。pUCm-T载体是一种已经线性化的载体,载体每条链的3’端带有一个突出的T。这样,pUCm-T载体的两端就可以和PCR产物的两端进行正确的AT配对,在连接酶的催化下,就可以把PCR产物连接到pUCm-T载体中,形成含有目的片段的重组载体。
    pUCm-T载体的主要信息如下:
    Base pairs                                              2773
    Lac Z promoter                                          142-171
    M13/pUC Sequencing Primer                               204-221
    Lac Z                                                   222-534
    Multiple cloning region                                 233-376
    M13/pUC Reverse Primer                                  378-395
    Synthetic Beta-lactamase (Ampr) coding region           972-1832
    ColE1 origin of replication(rep)                        1987-2606
    pUCm-T载体的图谱如图1:
            
                                  图1. pUCm-T载体图谱示意图
    pUCm-T载体的多克隆位点的详细序列如下(请特别注意其中的Pst I不是单酶切位点):
                                   Lac Z
                                   
    201 ACACAGGAAA   CAGCTATGAC   CATGATTACG   CCAAGCTTGC   ATGCCTGCAG
        TGTGTCCTTT   GTCGATACTG   GTACTAATGC   GGTTCGAACG   TACGGACGTC
              Xba I    Xho I BamH I   Bgl II
    251 GTCGACTCTA   GACTCGAGGG   ATCCAGATCT   CCAGTCTT GA  CCTGGTCTGC
        CAGCTGAGAT   CTGAGCTCCC   TAGGTCTAGA   GGTCAGA TCT  GGACCAGACG
        Pst INot I      Nco I EcoR V  Cla I   Nde I         T7 promoter
    301 AGGCGGCCGC   CCATGGGATA   TCATCGATCA   TATGTCGCCC   TATAGTGAGT
        TCCGCCGGCG   GGTACCCTAT   AGTAGCTAGT   ATACAGCGGG   ATATCACTCA
                 Kpn I   Sac I    EcoR I
    351 CGTATTACGG   TACCGAGCTC   GAATTCACTG   GCCGTCGTTT   TACAACGTCG
        GCATAATGCC   ATGGCTCGAG   CTTAAGTGAC   CGGCAGCAAA   ATGTTGCAGC
    pUCm-T载体中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pUCm-T)包括:
    Afl II    Age I    Apa I       Asc I     Avr II      Bbs I      Bbv II    Bcl I
    Blp I     BsaA I   BseR I      Bsg I     BsiC I      BsiW I     Bsm I     BsmF I
    Bsp120 I  BspM II  BsrG I      BssH II   Bst1107 I   BstB I     BstE II   BstX I
    Bsu36 I   Dra III  Eco47 III   Eco72 I   Esp I       Fse I      Hpa I     Mlu I
    Msc I     Mun I    Nae I       NgoM I    Nhe I       Nru I      Nsi I     PflM I
    Pme I     Pml I    PpuM I      PspA I    Rsr II      Sac II     Sfi I     Sma I
    SnaB I    Spe I    Spl I       Srf I     Stu I       Xca I      Xma I
    pUCm-T载体中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pUCm-T once)包括:

      HinD III  A`AGCT,T            234
      BspM I    ACCTGC 10/14        239
      Sph I     G,CATG`C            244
      Sal I     G`TCGA,C            252
      Acc I     GT`MK,AC            253
      HinC II   GTY|RAC             254
      Hind II   GTY|RAC             254
      Xba I     T`CTAG,A            258
      Ava I     C`YCGR,G            264
      PaeR7 I   C`TCGA,G            264
      Xho I     C`TCGA,G            264
      BamH I    G`GATC,C            270
      BsaB I    GATNN|NNATC         275
      Bgl II    A`GATC,T            276
      Xcm I     CCANNNN,N`NNNNTGG   289
      Tth111 I  GACN`N,NGTC         293
      Not I     GC`GGCC,GC          305
      Eag I     C`GGCC,G            305
      Xma III   C`GGCC,G            305
      Dsa I     C`CRYG,G            312
      Nco I     C`CATG,G            312
      Sty I     C`CWWG,G            312
      EcoR V    GAT|ATC             320
      Cla I     AT`CG,AT            325

Acc65 I    G`GTAC,C                360
Asp718     G`GTAC,C                360
Kpn I      G,GTAC`C                364
Ban II     G,RGCY`C                370
Sac I      G,AGCT`C                370
Apo I      R`AATT,Y                372
EcoR I     G`AATT,C                372
Kas I      G`GCGC,C                533
Nar I      GG`CG,CC                534
Ehe I      GGC|GCC                 535
Bbe I      G,GCGC`C                537
EcoO109 I  RG`GNC,CY               780
Aat II     G,ACGT`C                841
Ssp I      AAT|ATT                 955
Xmn I      GAANN|NNTTC             1160
Bsp1286 I  G,DGCH`C                1177
Sca I      AGT|ACT                 1279
EcoN I     CCTNN`N,NNAGG           1399
Cfr10 I    R`CCGG,Y                1675
Bsa I      GGTCTC 7/11             1694
Ahd I      GACNN,N`NNGTC           1760
AlwN I     CAG,NNN`CTG             2239
Afl III    A`CRYG,T                2648
Sap I      GCTCTTC 8/11            2765

    pUCm-T载体的全序列信息: D2006 pUCm-T vector-seq.txt
    pUCm-T载体是在pUC19载体的基础上改造而成,除多克隆位点外,其余序列同pUC19(GenBank Accession Number M77789)。
    少量自连的载体转化得到的克隆由于编码了LacZ基因,而在IPTG/X-Gal平板上呈现蓝色。大部分重组的载体,由于插入片段破坏了LacZ基因,因而在IPTG/X-Gal平板上转化得到白色克隆。这样就可以通过蓝白斑非常容易地筛选出重组克隆,蓝白斑筛选结果示意图如图2。
                              
    图2. pUCm-T载体的蓝白斑筛选结果示意图。pUCm-T载体和PCR产物片段进行连接,转化后在IPTG/X-Gal平板的上长出的克隆,其中白色克隆代表PCR产物片段可能插入到pUCm-T载体中,但后续还需要酶切、PCR或者测序确认。
    对于重组的质粒可以使用载体多克隆位点上的两个PstI酶切位点进行PstI单酶切鉴定,也可以使用廉价且高效的EcoRI、BamHI、XbaI、HindIII等内切酶进行双酶切鉴定。
    构建完成的质粒可以通过质粒上的正反两个M13引物位点进行测序或通过T7 promoter上的T7引物位点进行测序。
    构建完成的质粒可以利用T7 RNA polymerase promoter进行体外转录,用于探针标记等。
    一个包装的本载体共可以进行20次连接反应。
包装清单:

产品编号

产品名称

包装

D2006

pUCm-T载体

20μl

说明书

1份

保存条件:
   -20℃保存。
注意事项:
    本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。
    DNA聚合酶是否可以在PCR产物3’端加A需参考该DNA聚合酶的说明。对于PCR产物为平端的情况,不适合用于T载体的连接反应。对于平端的PCR产物可以先进行在3’端加A的反应,再用T载体进行克隆。
    进行PCR产物克隆时需自备连接、转化等相关试剂、试剂盒。
    本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
    为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用说明

使用说明:
1. PCR产物纯化:
    a. PCR产物可以通过PCR纯化试剂盒或凝胶回收试剂盒(例如碧云天生产的D0033 PCR纯化试剂盒
       D0056 DNA凝胶回收试剂盒)进行PCR产物纯化。对于PCR产物条带不是非常单一的情况,宜采用电
       泳后DNA凝胶回收的纯化方法,这样可以去除PCR扩增出来的非特异性条带的干扰。
2. 连接反应:
    a. 对于常规的DNA ligase连接反应,请参考下面的连接反应体系,或按DNA ligase的说明书进行操
       作。每个连接反应使用1微升pUCm-T载体,约0.2pmol PCR产物,在20微升连接体系中16℃连接过
       夜。

Sterilized Water

?μl

T4 DNA Ligase Buffer(10X)

2μl

Purified PCR Product

??μl

pUCm-T Vector

1μl

T4 DNA Ligase(5-10U/μl)

1μl

总体积

20μl

    b. 对于快速连接试剂盒,请参考相应说明书进行连接反应。pUCm-T 载体的用量还是为1微升,PCR
       产物的推荐用量约为0.2pmol。实际做连接反应时对PCR产物的使用量没有必要严格定量,根据
       PCR产物的亮度大致加入适量的PCR产物进行连接反应即可获得比较理想的连接效果。连接反应中
       使用的水尽量使用Milli-Q级纯水,或使用双蒸水或三蒸水。
3. 转化和筛选阳性克隆:
    按照常规方法进行转化和蓝白斑筛选。转化可以采用碧云天生产的D0302 超级感受态细菌制备试剂
    盒
。蓝白斑筛选所需的IPTG(ST098)和X-Gal(ST912)可以向碧云天购买。对于白斑可以进行酶切鉴
    定,通常酶切鉴定正确后可以进行测序鉴定。
相关产品:
产品编号 产品名称 包装
D2006 pUCm-T载体 20μl
D0033 PCR/DNA纯化试剂盒 50次
D0056 DNA凝胶回收试剂盒 50次
D0302 超级感受态细菌制备试剂盒 100次
ST097 IPTG 1g
ST098 IPTG 5g
ST912 X-Gal 100mg

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使用本产品的文献:
1. Hu J, Chai Y, Wang Y, Kheir MM, Li H, Yuan Z, Wan H, Xing D, Lei F, Du L.
   PI3K p55γ promoter activity enhancement is involved in the anti-apoptotic effect of
   berberineagainst cerebral ischemia-reperfusion.

   Eur J Pharmacol. 2012 Jan 15;674(2-3):132-42. doi: 10.1016/j.ejphar.2011.11.014.
   Epub 2011 Nov 19.
2. Zhou H, Chen S, Wang W, Wang Z, Wu X, Zhang Z.
   Nanog inhibits lipopolysaccharide-induced expression of pro-inflammatory cytokines by
   blocking NF-κBtranscriptional activity in rat primary microglial cells.

   Mol Med Rep. 2012 Mar;5(3):842-6. doi: 10.3892/mmr.2011.719. Epub 2011 Dec 19.




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