RNA研究好帮手(一)

T4 RNA连接酶系列,酶活性高,连接效率高!

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近年来,RNA研究一直是生命科学领域的研究热点,也是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域,研究成果也频频入选CNS年度十大科学突破。例如非编码RNA(miRNA、lncRNA、circRNA等),虽然不参与蛋白编码,不能直接行使功能,但是它可以通过多样化的调控方式参与众多的通路和生物过程,成为生物医药领域非常重要的一种调控分子。从全新的角度揭示生命调控的分子机制,并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术。
接下来,我们将分三期介绍多款最新上线的RNA研究相关的基础试剂,助力您的高分文章,请大家持续关注哦~

本期登场的1号种子选手是T4 RNA Ligase。虽然只是小小的工具酶,但是在R NA相关的研究过程中可是必不可少的呢。
本次推出的RNA连接酶新品包含三类,即T4 RNA Ligase 1,T4 RNA Ligase 2以及T4 RNA Ligase 2, truncated。

T4 RNA Ligase 1
碧云天生产的T4 RNA Ligase 1,即T4 RNA连接酶1,是一种ATP-依赖的可以催化单链RNA、单链DNA或单核苷酸分子间或分子内5'-P末端与3'-OH末端之间形成磷酸二酯键的酶。T4 RNA Ligase 1对于RNA之间的连接效率最高,DNA与RNA之间的连接效率次之,而DNA之间的连接效率最低,因此也被认为是一种ssRNA ligase。
用途:
1.   ssRNA的分子间连接和环化;
2.   ssRNA与ssDNA的分子间连接和环化;
3.   ssDNA之间连接和环化,但效率较低;
4.   ssRNA 3′-OH末端用放射性同位素5'-[32P]pCp等的标记;
5.   单链Oligo RNA及Oligo DNA的合成;
6.   tRNA的特别修饰;
7.   7.5'-RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)实验中将寡核苷酸连接到单链cDNA中;
8.   蛋白质中引入非天然氨基酸等
产品效果:
图1.碧云天生产的T4 RNA Ligase 1和N公司同类产品(Competitor T4 RNA Ligase 1)催化5'磷酸化3'羟基的单链RNA (pRNA-OH)环化连接生成环状RNA (circular RNA, cRNA)的效果图。使用本产品或国外N公司的T4 RNA Ligase 1,20μl 反应体系底物终浓度为0.5μM,37℃孵育30min进行连接反应,反应完毕后在65℃孵育15min终止反应,立即取样用15%尿素(7M)变性聚丙烯酰胺凝胶在冰水浴中进行电泳,最终进行核酸染色和荧光成像分析。如图所示,本产品与N公司的产品相比,同样具有良好的催化效果。

订购信息:

产品编号 产品名称 包装 产品价格
R0621S T4 RNA Ligase 1 (ssRNA Ligase) 1000U
R0621M T4 RNA Ligase 1 (ssRNA Ligase) 5000U

T4 RNA Ligase 2
碧云天生产的T4 RNA Ligase 2是一种ATP依赖的双链RNA连接酶(double-strand RNA ligase, dsRNA Ligase),也被称为T4 Rnl2 (gp24.1),可以用于双链RNA进行分子内的环化连接和分子间的线性连接。该酶在连接时需要5′磷酸和3′羟基的存在,可以是RNA链或DNA链的5′磷酸基和RNA链的3′羟基之间发生连接反应。T4 RNA Ligase 2T4 RNA Ligase 1 (R0621)区别在于T4 RNA Ligase 2对双链RNA中的缺刻(nick)的连接活性要大大高于对单链RNA末端的连接活性。
用途:
1.   主要用于连接双链RNA中缺刻的连接(即双链RNA的粘端连接),
2.   也可用于双链结构中,RNA 3′羟基与DNA 5′磷酸基的缺刻连接。
本产品酶活性高,连接效率高于国外同类竞争产品。
产品效果:
图2. 碧云天生产的T4 RNA Ligase 2和N公司的同类产品(Competitor T4 RNA Ligase 2)催化连接dsRNA粘端连接的效果图。 RNA-1:5’-OH-GGGCUUUGCGUGGGUUU-OH-3’;RNA-2 (5’端磷酸化):5’- pCUAUAGAAACCCACGCAAAGCCC-OH-3’,使用碧云天的R0051 Annealing Buffer for RNA oligos (5X),参考说明书进行退火反应。退火获得的dsRNA,在20µl反应体系中加入图中指定量的本产品或国外N公司的T4 RNA Ligase 2 (T4 Rnl2),37℃孵育30min进行连接反应,反应完毕后立即取样用15%非变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分析。如图所示,本产品与N公司的产品相比,实际的连接效率约为N公司产品的2倍,在本反应体系中碧云天生产的T4 RNA Ligase 2仅需0.5U即可完成大部分连接反应,2U就可以非常充分地完成连接反应。

订购信息:

产品编号 产品名称 包装 产品价格
R0632S T4 RNA Ligase 2 (dsRNA Ligase) 1000U

T4 RNA Ligase 2, truncated
碧云天生产的T4 RNA Ligase 2, truncated (T4 Rnl2, truncated或Rnl2 (1-249)),即T4 RNA连接酶2截短型,是一种不依赖于ATP的,依赖于5’端预腺苷酰化的单链核酸连接酶。该酶仅包含T4 RNA连接酶2 N端249个氨基酸,可特异性地将5’端预腺苷酰化的DNA或RNA (App-DNA或App-RNA)连接到RNA的3’羟基。常用于microRNA (miRNA)等3′端为羟基的单链RNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等时,在3′羟基端添加5′端预腺苷酰化的DNA或RNA接头。由于该酶只能利用5’端预腺苷酰化的单链DNA或RNA作为3’端接头,因此可大大降低连接反应的背景,通常是小RNA等建库时的优先选择。
用途:
1.   5’末端预腺苷酰化的单链DNA或者RNA与单链RNA的3’羟基末端连接;
2.   cDNA文库构建中连接5’末端预腺苷酰化单链寡核苷酸和小RNA;
3.   链特异性的cDNA文库(strand-specific cDNA library)构建中连接5’末端预腺苷酰化单链寡核苷酸和RNA;
4.   二代测序中,miRNA文库构建中RNA的3’末端与接头之间的连接;
5.   cDNA文库的构建以进行小RNA转录组分析(small-RNA transcriptome analysis)。
产品效果: 图3. 碧云天生产的T4 RNA Ligase 2, truncated和N公司的同类产品(Competitor T4 RNA Ligase 2, truncated)催化连接AppDNA和ssRNA的效果图。使用本产品或国外N公司的T4 RNA Ligase 2, truncated,即T4 Rnl2(1-249),在20µl反应体系中加入图中指定量的本产品或国外N公司的T4 Rnl2, truncated,25℃孵育60 min进行连接反应,反应完毕后立即取样在65℃孵育20 min终止反应,加入变性上样缓冲液,在95℃孵育5 min后放至冰浴中,随后用15%尿素(7M)变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分析,最终进行核酸染色和荧光成像分析。如图所示,本产品与N公司的产品相比,具有同样良好的催化效果。

订购信息:

产品编号 产品名称 包装 产品价格
R0635S T4 RNA Ligase 2, truncated 5kU
R0635M T4 RNA Ligase 2, truncated 20kU
R0635L T4 RNA Ligase 2, truncated 100kU

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下一期小编将为大家带来小RNA克隆、建库和PCR鉴定的相关新品,我们不见不散哦~