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核酸相关> 反转录与PCR> 反转录
BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser)
产品编号: D7180L
产品包装: 500次
产品价格: 2379.00元
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D7180L BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser) 500次 2379.00元

碧云天生产的BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser),即BeyoRT™ III First Strand cDNA Synthesis Kit with gDNA EZeraser,是一种同时提供了快速高效去除基因组DNA污染的gDNA EZeraser和BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X)的反转录试剂盒。加入gDNA EZeraser后仅需在37℃加热2分钟,就能有效去除基因组DNA污染,后续无需任何额外步骤,仅需加入水和BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X)就能进行反转录的非常简单、便捷、快速、稳定并且非常高效的cDNA第一链合成试剂盒。本产品对于3kb以下片段,10min就能完成反转录;产物长度可以长达12kb;可以在55℃进行高温反转录,有效解决复杂二级结构RNA反转录难的问题;预混液(5X)在-20℃不会结冻,取用非常便捷。
本试剂盒中的BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X)包含了经过改造和优化的快速高效(短至10min完成反转录)、热稳定(高达55℃)、高精确度、产物超长(长达12kb)的BeyoRT™ III M-MLV反转录酶、RNase Inhibitor、Oligo(dT)18 Primer、Random Hexamer Primer、dNTPs、MgCl2和反转录反应缓冲液,只需加入RNA模板和水(DEPC-treated Water或DNase/RNase-Free Water)就能进行反转录反应,大大简化了反转录的实验操作,使操作最为便捷,能有效避免常规反转录非常复杂的操作过程中可能导致的操作误差、孔间污染等,使反转录的重复性和平行性大幅提升。
本产品可广泛用于获得总RNA或mRNA后cDNA第一条链的合成,后续可以用于PCR、real-time PCR也称定量PCR (quantitative PCR, qPCR)、cDNA的第二链合成以及cDNA文库的构建,尤其是反转录所得目的基因的克隆等。BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser)还可以通过反转录用于DNA探针的荧光、生物素、地高辛或同位素标记等,也可以通过引物延伸(primer extension)来分析和研究RNA。
本产品中的gDNA EZeraser其主要有效成分为热敏性dsDNase (Thermolabile dsDNAse),能特异性地降解双链基因组DNA,效率高,作用时间短,在充分去除残留基因组DNA之后不会对cDNA造成显著影响。热敏性dsDNase加入本试剂盒中的BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X)就能充分抑制其活性,并且在55℃加热5min就能导致完全失去酶活性。后续如果用于常规PCR或qPCR,PCR的首次变性条件能充分失活gDNA EZeraser,因此不必担心gDNA EZeraser对于后续的常规PCR或qPCR的干扰。使用本产品可以有效避免总RNA中的gDNA对于后续qPCR定量的干扰。另一方面,也有助于简化qPCR引物设计,无需进行跨内含子引物设计。
BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser)中的BeyoRT™ III M-MLV reverse transcriptase,是一种经过改造和优化的快速高效(短至10min完成反转录)、热稳定(高达55℃)、高精确度、产物超长(长达12kb)的M-MLV反转录酶,具有正常的依赖于RNA或DNA模板的DNA聚合酶活性,能够以RNA或DNA为模板,在引物存在的情况下进行互补DNA链的合成,即可以进行cDNA(complementary DNA)的第一链合成,同时它保留了RNase H的活力,能选择性剪切RNA和DNA杂合双链中的RNA,有利于后续cDNA第二链的合成。
本产品经测试可以轻松完成长度为8 kb及以下基因的反转录,反转录的最大长度可以达到12 kb。BeyoRT™ III M-MLV反转录酶热稳定性好,反转录效率高,最适反应温度为42℃,当温度达到50℃时仍具有很高活性。对于长度较短的cDNA反转录,温度达到55℃时也可获得较高产量的cDNA。高温反转录对于高GC含量RNA的反转录,能有效减少二级结构,提升反转录效率。反转录速度快,6kb以下的cDNA反转录只需0.5h即可完成,3kb以下的cDNA反转录10min即可完成。
本产品反转录效率高,BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser)的反转录效率与非预混液的反转录效率一致(参考图1)。
如果希望进行常规的反转录操作,可以单独选购BeyoRT™ III M-MLV反转录酶(D7176),RNase Inhibitor (R0102)dNTP mix (D7373),或者选购BeyoRT™ III cDNA第一链合成试剂盒(D7178)进行反转录反应。
本产品操作便捷,去除基因组DNA污染仅需2分钟,同时采用了第一链合成预混液(5X),即反转录预混液(5X),后续只需加入水和反转录预混液(5X),即可快速进行反转录反应,并且BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X)在-20℃不会结冻,使用非常便捷。
本产品重复性好,反转录所有试剂预混合,大大减少操作步骤,有效降低污染几率和操作误差,使实验结果更加一致,重复性更好。

图1. 使用碧云天的BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser)和使用BeyoRT™ III M-MLV反转录酶的常规反转录体系的效果对比图。在20μl的反转录反应体系中,以HEK293T细胞中提取的1µg总RNA为模板,没有加入反转录酶、分别使用BeyoRT™ III M-MLV反转录酶的常规反转录体系和BeyoRT™ III cDNA合成试剂盒(with gDNA EZeraser),42℃反转录60min。然后取1μl反转录产物分别进行两个目的基因的PCR扩增和电泳检测。

失活或抑制:80℃孵育10min可以导致本产品中的BeyoRT™ III M-MLV反转录酶失活;EDTA、EGTA等螯合剂、无机磷酸盐或焦磷酸盐以及聚氨(polyamine)对BeyoRT™ III M-MLV反转录酶有抑制作用。55℃孵育5min可以导致本产品中的gDNA EZeraser失活,并且本试剂盒中的BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X)在反转录体系中能充分抑制gDNA EZeraser活性。
对于20μl反转录体系,本试剂盒的不同包装分别足够进行20次、100次和500次反转录反应。
包装清单:

产品编号 产品名称 包装
D7180L-1 BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X) 2ml
D7180L-2 gDNA EZearser 500μl
D7180L-3 gDNA EZearser Buffer (10X) 600μl
说明书 1份

保存条件:
-20℃保存。
注意事项:
对于GC含量比较高的RNA的反转录,产品的使用说明中给予了特别说明,请予以关注。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

使用说明:
1. 去除RNA样品中的基因组DNA:
a. 将RNA样品、gDNA EZearser Buffer (10X)、DEPC-treated Water在室温(15-25℃)解冻,解冻后立即置于冰上。使用前将每种溶液混匀并短暂离心以使所有液体沉降至管底。
b. RNA的变性(可选做),把RNA样品在65℃条件下热变性5 min后,立即置于冰水中冷却。经过本步骤处理后,对于容易形成高级结构的RNA可以有效提高反转录的效率。初次实验时,建议对于是否需要变性进行摸索。
c. 按下表成分于冰上配制反应混合液。为了保证反应体系配制的准确性,进行反转录反应时,可以先配制适量DEPC-treated Water、gDNA EZearser Buffer (10X)和gDNA EZeraser的混合物,然后分装到每个反应管中,最后加入RNA样品。

试剂 使用量
DEPC-treated Water xμl*
gDNA EZearser Buffer (10X) 1μl
gDNA EZearser 1μl
RNA sample up to 1μg**
总体积 10μl

*xμl表示加入的体积须根据实际情况确定,使最终体积为10μl。
**常规的20μl反转录反应体系,可使用10pg到1μg的Total RNA,建议使用0.5-1μg的Total RNA。
d. 在PCR仪上或水浴中,37℃孵育2min。
e. 立即置于冰上,或者迅速切换到55℃孵育5min,随后置于冰上放置。55℃孵育5min能充分失活gDNA EZeraser,但后续加入BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X)也能充分抑制gDNA EZeraser的活性。
2. cDNA第一条链的合成(First-stand cDNA Synthesis):
a. 每管加入6μl水(DEPC-treated Water)和4μl BeyoRT™ III cDNA第一链合成预混液(5X),总体积20μl。
b. 轻轻混匀(用移液器轻轻吹打混匀或用涡旋混合器在最低速度轻轻混匀),随后离心沉降液体。
c. 42℃孵育10-60 min。反转录3kb以下的cDNA,反转录10min即可,反转录3-6kb的cDNA,反转录30min即可,而6kb以上的cDNA推荐反转录60min。后续用于qPCR时,检测任何长度的基因,通常反转录10min就足够了。注意:对于GC含量较高或二级结构比较严重的模板RNA,可以50℃反转录60 min,以充分利用本产品反转录酶在50℃时仍有良好的反转录酶活性这一特点,在较高温度进行反转录可以有效减少二级结构的干扰。
d. 80℃孵育10 min以失活反转录酶(可以同时失活gDNA EZeraser)并终止反转录反应。说明:对于5kb以上的长片断cDNA不推荐采用加热的方法失活反转录酶,该方法易导致部分长片断DNA被剪切,此时可考虑酚氯仿抽提或柱纯化方法。
e. 反转录产物可以直接用于后续的PCR反应等,也可以-20℃冻存以备以后使用。用于后续PCR反应时,如果PCR的反应体系为20μl和50μl,则推荐相应地使用0.8μl和2μl反转录产物。
3. 引物延伸、探针标记等其它用途请自行参考M-MLV反转录酶的相关文献资料进行。

常见问题:
1. 总RNA反转录产物电泳观察不到。
a. 反转录产物由于是从模板反转录而获得,而模板的量本身比较低,反转录的量通常还要少于模板量,并且总RNA的反转录产物大小很不均匀,因此通常总RNA的反转录产物直接电泳观察是观察不到的。
2. 反转录产物通过PCR扩增没有特异性条带。
a. PCR扩增没有获得特异性条带时建议先使用actin、GAPDH等作为内参进行PCR扩增,看是否可以成功扩增。如果可以成功,则说明PCR扩增体系没有问题,此时通常是目的基因的引物设计欠佳,当然也有可能是反转录产物质量欠佳。如果内参不能被很好地扩增,则有可能PCR体系存在问题或反转录产物质量欠佳。
b. 模板RNA发生了降解。哺乳动物细胞或组织的总RNA琼脂糖电泳后应该可以看到清晰的18S和28S rRNA条带,并且28S rRNA和18S rRNA的亮度比例应该大于等于2.0。如果比例小于2.0,则提示总RNA发生了显著的降解,最好能重新制备总RNA样品。避免RNA降解的主要方法是,严格进行RNA的相关操作,包括带洁净手套、戴一次性口罩、在洁净环境中抽提或制备RNA,以尽量避免RNase污染。
c. 模板RNA的纯度偏低。在提取纯化RNA的过程中,残留在溶液中的一些成分如苯酚、SDS、EDTA、胍盐、磷酸、焦磷酸、多胺、亚精胺等会抑制反转录酶活性。对RNA样品进行柱纯化,或者进行沉淀、洗涤和再溶解,通常可以有效去除残留的污染物。通常选择使用碧云天的BeyoZol或Trizol抽提获得的总RNA完全可以满足反转录反应的需要。
d. 反转录反应的模板量不足。在抽提获得总RNA后,在进行一些精细的定量检测时通常会进行DNase I消化,以充分去除可能的残留的DNA的干扰。DNase I进行热失活时,需要加入EDTA至终浓度为2.5mM,否则RNA在没有螯合剂的情况下,在加热过程中容易被水解,从而导致模板量不足。此外,扩增特定基因时,需要先查询该基因的组织分布特点,利用其高表达的组织进行目的基因的反转录和克隆。用该基因丰度极低的组织或细胞样品进行反转录和PCR扩增,通常会由于模板量过少而PCR扩增失败。
e. 如果RNA模板富含GC或容易形成二级结构,此时可以考虑把反转录温度提高到45-55℃。

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