产品编号 | 产品名称 | 产品包装 | 产品价格 |
R7040S | XRN-1 | 20U | 428.00元 |
R7040M | XRN-1 | 100U | 1698.00元 |
R7040L | XRN-1 | 500U | 6698.00元 |
碧云天生产的XRN-1,又称5’-Phosphate Dependent Exonuclease (5’-磷酸依赖的核酸外切酶)。它是由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台通过大肠杆菌表达、纯化获得的一种高活性的5’-3’核糖核酸外切酶(5’-3’ Exoribonucleases),并要求底物RNA的5’端为单磷酸修饰,是一种可用于催化5’端单磷酸化RNA (p-RNA)以5’→3’方向降解为NMP的5’核酸外切酶。XRN-1也可以消化具有5’端单磷酸化的单链DNA (ssDNA),但酶切效率较低[1]。XRN-1不能消化具有5’端三磷酸(5’-ppp)、5’端二磷酸(5’-pp)、5’加帽(5’-cap)和5’端羟基(5’-OH)的RNA、双链DNA (dsDNA) 和5’端为羟基、三磷酸或二磷酸的单链DNA,XRN-1也不能消化5’磷酸末端凹陷的双链RNA、DNA与RNA杂合链或形成类似二级结构中的5’磷酸RNA [1-3]。XRN-1发挥活性需要Mg2+ [3],其催化的反应如下:
p-RNA → NMP
XRN-1的酶学性质使得其可以被应用于选择性消化核糖体RNA (rRNA),在不依赖于oligo-dT磁珠或琼脂糖凝胶的情况下,可以从总RNA中分离和富集信使RNA (mRNA),以便于构建mRNA测序文库[4]。XRN-1也可以用于RNA的5’末端分析等。
碧云天XRN-1水解5’端单磷酸化RNA的荧光实时分析请参考图1。
图1. 碧云天XRN-1 (R7040)与国外L公司(Competitor L)的XRN-1对5'端单磷酸化RNA水解效果对比图。图A,发光原理。分别合成带有荧光基团的单链RNA-FAM和单链DNA-TAMRA,通过退火得到RNA/DNA杂交链[5],TAMRA由于靠近FAM基团,可猝灭FAM的荧光。随着XRN-1消化RNA,FAM从从退火的双链寡核苷酸中释放,并在520nm波长处可检测到FAM荧光。图B,荧光法活性检测。配制100μl反应体系:50mM Tris-HCl (pH8.0),100mM NaCl,2mM MgCl2,20U RNase Inhibitor (R0102),250nM底物RNA/DNA,0或20nM XRN-1。检测条件:激发波长494nm,发射波长520nm,温度30ºC,每10秒检测一次,共检测200秒。碧云天与L公司的XRN-1相比,图中对5’端单磷酸化RNA的水解效果更优。图中数据仅供参考,不同实验条件下获得的数据会有一定的差异。
碧云天XRN-1对哺乳动物细胞中提取的总RNA中rRNA的水解效果请参考图2。
图2. 碧云天XRN-1 (R7040)对哺乳动物细胞总RNA中rRNA的水解效果图。反应体系为20μl,总RNA含量为1μg,XRN-1为1μl,反应条件为30ºC孵育120分钟,反应完毕后加入2X RNA Loading Buffer (R0215)终止反应,随后取20μl用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。如图所示,1μl XRN-1在30ºC条件下,120分钟可以消化95%以上的rRNA。碧云天与L公司的XRN-1相比,对rRNA的水解效果基本一致。图中数据仅供参考,不同实验条件下获得的数据会有一定的差异。
来源:由大肠杆菌表达,表达基因为酵母的XRN-1基因。
分子量:约175kDa。
活性定义:One unit digests 1μg of rRNA substrate into acid-soluble nucleotides in 60 minutes at 30ºC under standard assay conditions。
纯度:不含自身活性之外的RNA酶,不含自身活性之外的DNA内切酶和外切酶。
Storage (Dilution) Buffer: 20mM Tris-HCl (pH7.5), 500mM NaCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 0.1% Triton X-100 and 50% Glycerol.
10X Reaction Buffer: 500mM Tris-HCl (pH8.0), 1M NaCl, 20mM MgCl2.
失活或抑制:反应体系中超过1mM EDTA会对XRN-1的酶活造成抑制[3]。此外,70ºC孵育10分钟可使XRN-1失活。RNase Inhibitor例如碧云天生产的R0102不会抑制其酶活性。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R7040S-1 | XRN-1 (1U/μl) | 20μl |
R7040S-2 | 10X Reaction Buffer | 200μl |
R7040S-3 | Storage (Dilution) Buffer | 200μl |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R7040M-1 | XRN-1 (1U/μl) | 100μl |
R7040M-2 | 10X Reaction Buffer | 1ml |
R7040M-3 | Storage (Dilution) Buffer | 1ml |
- | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R7040L-1 | XRN-1 (1U/μl) | 500μl |
R7040L-2 | 10X Reaction Buffer | 5ml |
R7040L-3 | Storage (Dilution) Buffer | 5ml |
- | 说明书 | 1份 |
-20ºC保存,至少两年有效。
注意事项:酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20ºC保存。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Control | Sample | ||
Volume | Conc. or amount | Volume | Conc. or amount | |
Ultrapure Water | (16.5-X)μl | - | (16.5-X)μl | - |
10X Reaction Buffer | 2μl | 1X | 2μl | 1X |
RNase Inhibitor (40U/μl) | 0.5μl | 20U | 0.5μl | 20U |
RNA Sample | Xμl | 1μg | Xμl | 1μg |
Storage (Dilution) Buffer | 1μl | - | - | - |
XRN-1 (1U/μl) | - | - | 1μl | 1U |
Total volume | 20μl | - | 20μl | - |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D2308-10μg | pT3/SP6/T7-RNA Linearized Template (RNA体外转录质粒) | 10μg |
D2310-1μg | pT3/SP6/T7-RNA-Template (RNA体外转录质粒) | 1μg |
D2310-100μg | pT3/SP6/T7-RNA-Template (RNA体外转录质粒) | 100μg |
D2312-1μg | pRNA-T3-T7 (RNA体外转录质粒) | 1μg |
D2312-100μg | pRNA-T3-T7 (RNA体外转录质粒) | 100μg |
D2314-1μg | pRNA-SP6-T7 (RNA体外转录质粒) | 1μg |
D2314-100μg | pRNA-SP6-T7 (RNA体外转录质粒) | 100μg |
D6128S | BsaI | 1kU |
D6128M | BsaI | 5kU |
D6128L | BsaI | 20kU |
D6128XL | BsaI | 200kU |
D7383-1ml | NTP set (100mM each, Nuclease free) | 4×250μl |
D7385-500μl | NTP Mix (10mM each, Nuclease free) | 500μl |
D7385-2ml | NTP Mix (10mM each, Nuclease free) | 2ml |
D7387-250μl | NTP Mix (25mM each, Nuclease free) | 250μl |
D7387-1ml | NTP Mix (25mM each, Nuclease free) | 1ml |
R0016 | Trizol (总RNA抽提试剂) | 100ml |
R0021 | DEPC水(DNase、RNase free) | 100ml |
R0022 | DEPC水(DNase、RNase free) | 500ml |
R0051 | Annealing Buffer for RNA Oligos (5X) | 1ml |
R0081-1ml | BeyoMag™ RNA Clean Magnetic Beads (RNA纯化磁珠) | 1ml |
R0081-5ml | BeyoMag™ RNA Clean Magnetic Beads (RNA纯化磁珠) | 5ml |
R0081-20ml | BeyoMag™ RNA Clean Magnetic Beads (RNA纯化磁珠) | 20ml |
R0081-100ml | BeyoMag™ RNA Clean Magnetic Beads (RNA纯化磁珠) | 100ml |
R0102-2kU | RNase Inhibitor | 2000U |
R0102-10kU | RNase Inhibitor | 10000U |
R0102-50kU | RNase Inhibitor | 50000U |
R0107 | 氧钒核糖核苷复合物(RNase抑制剂) | 2ml |
R0108 | 氧钒核糖核苷复合物(RNase抑制剂) | 10ml |
R0123 | RNase and DNase Away | 250ml |
R0125 | RNase, DNase and DNA Away | 250ml |
R0127 | RNase, DNase, RNA and DNA Away | 250ml |
R0215-1ml | 2X RNA Loading Buffer | 1ml |
R7006S | SP6 RNA Polymerase | 1KU |
R7006M | SP6 RNA Polymerase | 5KU |
R7006L | SP6 RNA Polymerase | 25KU |
R7006XL | SP6 RNA Polymerase | 100KU |
R7009S | T3 RNA Polymerase | 1KU |
R7009M | T3 RNA Polymerase | 5KU |
R7009L | T3 RNA Polymerase | 25KU |
R7009XL | T3 RNA Polymerase | 100KU |
R7012S | T7 RNA Polymerase | 1KU |
R7012M | T7 RNA Polymerase | 5KU |
R7012L | T7 RNA Polymerase | 25KU |
R7012XL | T7 RNA Polymerase | 100KU |
R7016S | T7 Quick High Yield RNA Transcription Kit | 25次 |
R7016M | T7 Quick High Yield RNA Transcription Kit | 100次 |
R7018S | T7 High Yield RNA Transcription Kit | 25次 |
R7018M | T7 High Yield RNA Transcription Kit | 100次 |
R7020S | SP6 High Yield RNA Transcription Kit | 25次 |
R7020M | SP6 High Yield RNA Transcription Kit | 100次 |
R7023S | Pyrophosphatase, Inorganic (E. coli) | 10U |
R7023M | Pyrophosphatase, Inorganic (E. coli) | 50U |
R7023L | Pyrophosphatase, Inorganic (E. coli) | 200U |
R7023XL | Pyrophosphatase, Inorganic (E. coli) | 1000U |
R7025S | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) | 10U |
R7025M | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) | 50U |
R7025L | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) | 200U |
R7025XL | Pyrophosphatase, Inorganic (yeast) | 1000U |
R7027S | Thermostable Inorganic Pyrophosphatase | 250U |
R7027M | Thermostable Inorganic Pyrophosphatase | 1250U |
R7027L | Thermostable Inorganic Pyrophosphatase | 5KU |
R7027XL | Thermostable Inorganic Pyrophosphatase | 25KU |
R7035 | RNA 5' Pyrophosphohydrolase (RppH) | 200U |
R7070S | E. coli Poly(A) Polymerase | 100U |
R7070M | E. coli Poly(A) Polymerase | 500U |
R7070L | E. coli Poly(A) Polymerase | 2.5kU |
R7070XL | E. coli Poly(A) Polymerase | 10kU |
R7075S | Poly(A) Polymerase Tailing Kit | 50-250次 |
R7090FT | Thermostable RNase H | 50U |
R7090S | Thermostable RNase H | 250U |
R7090M | Thermostable RNase H | 1000U |
R7090L | Thermostable RNase H | 5000U |
R0722S | Circular RNA Synthesis Kit | 20次 |
R0722M | Circular RNA Synthesis Kit | 100次 |
ST876-500ml | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 500ml |
ST876-100ml | BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) | 100ml |